Proteómica

Grupo Proteómica

Proteómica

 

Responsable de la Unidad: Gemma Barroso García

E-mail: gbarroso@sescam.jccm.es

 

La Unidad de Proteómica tiene por misión el poner a disposición de los investigadores las técnicas basadas en el análisis de proteínas, centrándose en la búsqueda de diseños experimentales adecuados e implantación de nuevas tecnologías en el ámbito de la Proteómica.

 

La unidad dispone de la instrumentación necesaria para la realización de experimentos de separación, cuantificación, identificación y caracterización de proteínas, así como para el estudio de sistemas de interés biológico y biomédico mediante técnicas de electroforesis y espectrometría de masas. Las técnicas proteómicas son válidas para la realización de estudios en investigación clínica.

 

Asimismo la unidad participa desde el año 2008 en el programa de formación continuada del Hospital Nacional de Parapléjicos-SESCAM, impartiendo cursos de Introducción a la Proteómica Básica.

 

 

Equipamiento

 

Espectrometría de masas

  • 4800 Plus MALDI TOF/TOF (ABSciex).
  • Nano-LC (Dionex Ultimate 3000) con micro-colector de fracciones Probot (Dionex).
  • 4000 QTrap: (ABSciex).
  • Nano-LC (Eksigent 2D Plus) acoplado al espectrómetro 4000 QTrap

 

Software para análisis de datos

  • GPS Explorer™ , ProteinPilot™ (ABSciex). Programas de búsqueda automatizada de proteínas que incluyen el motor de búsqueda MASCOT V2.5
  • MRMPilot (ABSciex) y Skyline para proteómica cuantitativa.

 

Electroforesis y Análisis de imagen 2D-gel

  • Sistemas de isoelectroenfoque:
  • Ettan IPGphor 3 (GE Healthcare)
  • PROTEAN IEF Cell (BioRad)
  • Sistemas de electroforésis:
  • Ettan Dalt Six (GE Healthcare)
  • Hoefer SE 600 (GE Healthcare)
  • Mini-PROTEAN 3 Dodeca Cell y Mini-PROTEAN Tetra Cell (BioRad)
  • ImageScanner III:
  • Typhoon™ TRIO: Escáner para la visualización de imágenes fluorescentes, especialmente diseñado para geles DIGE (GE Healthcare).
  • DeCyder™ Software específico para el análisis de expresión diferencial de geles de proteínas marcadas con tecnología DIGE (GE Healthcare).

 

Preparación de muestras en gel para identificación mediante espectrometría de masas:

  • EXQuest Spot Cutter: (BioRad)
  • Ettan Digester: (GE Healthcare)

 

 

 

Servicios y tarifas

 

Haz click aquí para conocer nuestras tarifas

 

 

Separación de proteínas: Petición de Ensayo

     - Electroforesis en geles de poliacrilamida (SDS-PAGE)

     - Electroforesis 2D (2-DE)

     - Electroforesis 2D diferencial cuantitativa (2D-DIGE)

 

 

Análisis por espectrometría de masas: Petición de Ensayo

     - Determinación de masa molecular.

     - Estudios de fragmentación por ión.

     - Identificación de proteínas por MALDI.

     - Identificación de proteínas por LC-MS/MS.

     - Análisis Cuantitativo:

            SRM/MRM (Selected Reaction Monitoring/Multiple Reaction Monitoring)

 

 

 

Publicaciones y comunicaciones recientes

 

Pita-Thomas W, Barroso-García G, Moral V, Hackett AR, Cavalli V, Nieto-Diaz M. Identification of axon growth promoters in the secretome of the deer antler velvet Neuroscience. 2016 Nov 4. pii: S0306-4522(16)30604-2 Citada en PubMed; PMID: 27818162

 

Sánchez-Sierra M, García-Álvarez I, Fernández-Mayoralas A, Moreno-Lillo S, Barroso García G, Moral Dardé V, Doncel-Pérez E. Mass Spectrometry in Pharmacokinetic Studies of a Synthetic Compound for Spinal Cord Injury Treatment. Biomed Res Int. 2015;2015:169234 Citada en PubMed; PMID: 26090386

 

SPINAL CORD INJURY INDUCES LONG-TERM CHANGES IN THE RAT SPLEEN PROTEOME Angel Arevalo-Martin, Daniel Garcia-Ovejero, Veronica M Darde, Gemma Barroso, Yolanda Sierra-Palomares, Eduardo Molina-Holgado. 3rd International Spinal Cord Repair Meeting,  6-7 noviembre 2015 Barcelona.

 

Multiple Reaction Monitoring analysis reveals changes in S1P-S1Preceptor axis following spinal cord injury. Ángela del Águila, Verónica M. Darde, Gemma Barroso-García, Ana Gallardo-Escobar, David Reigada, Teresa Muñoz- Galdeano, Rosa Navarro-Ruiz, Marcos Caballero López, Rodrigo M. Maza, Manuel Nieto-Díaz.. 13th Human Proteome Organization World Congress October 5-8, 2014 Madrid, España

 

 

Personal

 

Barroso García, Gemma. Responsable de la Unidad.

e-mail: gbarroso@sescam.jccm.es

 

 

Gallardo Escobar, Ana. Preparación de muestras.

e-mail: agallardoe@sescam.jccm.es

 

 

González Arandilla, Alba. Especialista Espectrometría de masas.

e-mail: agarandilla@sescam.jccm.es

 

 

 

Contacto

 

Unidad de Proteómica

Edf. Investigación i-1Lab 21

Hospital Nacional de Parapléjicos

Finca La Peraleda s/n

45071 Toledo

España

 

E-mail: unidadproteomica.hnp@sescam.jccm.es

Tfno: (+34) 925 396 823

Tfno 2: (+34) 638 228 821

Fax: (+34) 925 396 821